GEO公共數(shù)據(jù)庫(kù)中4例多指畸形患者細(xì)胞間質(zhì)和上皮細(xì)胞的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析

摘要： 背景：多指畸形患者中參與Heghog信號(hào)通路的一些轉(zhuǎn)錄因子發(fā)生異常表達(dá)，這些轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控大量靶基因的表達(dá)，從而影響細(xì)胞的功能。目的：通過(guò)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析多指畸形患者的轉(zhuǎn)錄組特征。方法：從GEO公共數(shù)據(jù)庫(kù)中下載4例多指畸形患者細(xì)胞間質(zhì)和上皮細(xì)胞的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，將成纖維細(xì)胞和角質(zhì)細(xì)胞劃分為細(xì)胞亞群，并分析不同亞群的轉(zhuǎn)錄因子，構(gòu)建轉(zhuǎn)錄因子及其靶基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，分析調(diào)控因子的功能。... ... （共10頁(yè)）

多指畸形 轉(zhuǎn)錄因子 生物信息學(xué) 單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析 微環(huán)境 Heghog信號(hào)通路 大數(shù)據(jù)分析