基于nanoLC-LTQ/OrbitrapMS分析山羊角中蛋白質多肽類物質

摘要： 基于shotgun混合蛋白質鑒定思路,研究山羊角水提液中蛋白質類、肽類物質組成。采用超高分辨的線性離子阱-靜電場軌道阱質譜(LTQ/OrbitrapMS),從山羊角水提液中大于3ku部位鑒定出52個蛋白質,從小于3ku部位鑒定出1288個肽段,這些肽段源于46個蛋白質。鑒定出的蛋白質主要為角蛋白、膠原蛋白、角蛋白相關蛋白等結構蛋白。根據每個氨基酸出現的頻次,將蛋白質上的肽段標記,繪制熱圖(heatmap),據此推測山羊角水提液中多肽類物質形成的過程為:從蛋白質的熱區(qū)(hotregions)中經過降解、脫落、溶出,形成水提液中的各種肽段。該方法能夠快速、高效地分析鑒定山羊角水提液中蛋白質肽類物質組成,可用于角類動物藥蛋白質類物質組成與分析,也可為中藥動物藥的系統(tǒng)研究提供借鑒與方法參考。 （共7頁）