基于Illumina HiSeq 2000測序技術(shù)對當(dāng)歸根的轉(zhuǎn)錄組特性研究

摘要： 目的識別當(dāng)歸Angelica sinensis根藥用活性物質(zhì)的基因序列,闡釋當(dāng)歸次生代謝產(chǎn)物生物合成的遺傳基礎(chǔ)。方法從當(dāng)歸頭、當(dāng)歸尾提取總RNA,質(zhì)量鑒定合格后構(gòu)建測序文庫。測序文庫檢測合格后在Illumina Hi Seq 2000測序儀上完成雙端測序。采用相關(guān)生物信息學(xué)方法分析當(dāng)歸根的轉(zhuǎn)錄組特性。結(jié)果采用Illumina Hi Seq 2000高通量測序獲得當(dāng)歸根轉(zhuǎn)錄組的66 431 540個原始短讀序。用生物信息學(xué)方法從頭組裝并注釋了30 432個功能基因序列(unigene)。應(yīng)用Uniprot蛋白數(shù)據(jù)庫進(jìn)行序列相似性比對,當(dāng)歸功能基因序列主要分布于目前研究較深入的7種重要經(jīng)濟(jì)作物,如葡萄、蓖麻、毛果楊、大豆、苜蓿、擬南芥和煙草。研究發(fā)現(xiàn),當(dāng)歸根表達(dá)的127、69、70、94個unigene分別映射到類苯基丙烷生物合成、N-聚糖生物合成、黃酮類化合物生物合成和葉酸生物合成等路徑,可能參與藥用活性物質(zhì)阿魏酸、當(dāng)歸多糖、當(dāng)歸總黃酮和葉酸的生物合成。結(jié)論參與當(dāng)歸根重要藥效物質(zhì)(阿魏酸、當(dāng)歸多糖、當(dāng)歸總黃酮等)生物合成的功能基因序列可能是當(dāng)歸補(bǔ)血、活血功效的分子生物學(xué)基礎(chǔ)。 （共7頁）