基于Illumina MiSeq高通量測(cè)序分析黃芪內(nèi)生真菌的多樣性

摘要： 目的:分析黃芪內(nèi)生真菌群落多樣性,為篩選菌種進(jìn)行發(fā)酵炮制轉(zhuǎn)化黃芪中活性成分的定向炮制工藝研究提供參考依據(jù)。方法:應(yīng)用Illumina MiSeq高通量測(cè)序技術(shù)測(cè)定黃芪內(nèi)生真菌的18S rDNA NS1-Fung區(qū)域序列并進(jìn)行物種豐度等生物信息分析。結(jié)果:獲得有效序列29 677條,操作分類(lèi)單元188個(gè),測(cè)序數(shù)量接近于飽和,測(cè)序數(shù)據(jù)量合理。黃芪內(nèi)生真菌主要分布于駝孢銹菌屬(Hemileia),赤霉菌屬(Gibberella),糞盤(pán)菌屬(Ascobolus),假裸囊菌屬(Pseudogymnoascus)和曲霉屬(Aspergillus)共5個(gè)屬。結(jié)論:黃芪內(nèi)生真菌群落多樣性較低,Hemileia和Gibberella是黃芪內(nèi)生真菌的優(yōu)勢(shì)種群。 （共5頁(yè)）