基于Illumina高通量測序的泡桐轉錄組研究

摘要： 利用新一代高通量測序技術平臺Illumina Solexa對泡桐進行轉錄組測序和數據denovo組裝,并對得到的unigene進行功能注釋、分類及代謝通路分析。結果表明,N50值為2278bp、平均長度為1410bp的泡桐unigene共有188019條,將其與NCBI的Nr和Swiss-Prot數據庫比對后發(fā)現,分別有120808條和85880條unigene與其他物種的基因具有同源性。利用COG數據庫可將有關的41914條泡桐unigene分成25類,KEGG數據庫分析發(fā)現共有43553個unigene參與215種代謝通路。找到與木質素合成相關的泡桐unigene。 （共7頁）