基于Illumina測(cè)序的厚殼貽貝足組織轉(zhuǎn)錄組研究
中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào)
頁(yè)數(shù): 11 2015-08-20
摘要: 貽貝足絲是貽貝足組織分泌的足絲蛋白形成的非細(xì)胞組織,具有在水環(huán)境下的極強(qiáng)粘附性能,是當(dāng)前生物粘附劑及抗腐蝕材料的研發(fā)熱點(diǎn).為進(jìn)一步了解貽貝足絲蛋白的分子多樣性特征,采用新一代Illumina高通量測(cè)序平臺(tái)對(duì)厚殼貽貝(Mytilus coruscus)足組織進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,首次構(gòu)建了厚殼貽貝足組織的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù).共計(jì)獲得7 199 799 840 nt的堿基數(shù)據(jù).經(jīng)過序列拼接和組裝,獲得88 825條unigene.對(duì)上述unigene開展了序列注釋,共計(jì)37 007條unigene獲得注釋.在此基礎(chǔ)上,經(jīng)序列檢索和比對(duì),從中篩選出與目前已知的11種足絲蛋白同源的56條unigene序列并進(jìn)行分析.結(jié)果表明,厚殼貽貝足絲蛋白具有明顯的氨基酸偏好性,部分足絲蛋白具有重復(fù)序列,且厚殼貽貝足絲蛋白與其他種類的貽貝足絲蛋白具有較高的序列相似性.上述結(jié)果為后續(xù)貽貝足絲蛋白的批量鑒定以及在此基礎(chǔ)上的貽貝足絲形成、固化以及粘附機(jī)制相關(guān)研究奠定了基礎(chǔ). (共11頁(yè))