基于Illumina高通量測序的巖原鯉轉錄組分析

摘要： 為獲得巖原鯉轉錄組信息,發(fā)掘功能基因,本研究采用Illumina高通量測序技術對巖原鯉全組織轉錄組進行測序。結果獲得64 257 918個EST序列,經拼接和組裝得到83 252條單基因序列(unigene),平均長度787 bp,長度范圍201~16 572 bp。利用NCBI的蛋白質非冗余數(shù)據(jù)庫(Nr)對所有unigene進行相似性搜索,共有37 157條unigene(44.63%)與數(shù)據(jù)庫中的已知序列同源。利用Blast2GO v2.5軟件對unigene進行注釋,共得到29 919條(35.93%)注釋基因,根據(jù)GO功能分類將其分為生物過程、細胞組分和分子功能3大類56亞類。經KOG注釋及分類,共有17 869條(21.49%)unigene成功注釋到真核直系同源組中,并將其分為26個功能組分。經KEGG代謝通路分析可分為5大類(細胞過程、環(huán)境信息處理、遺傳信息處理、代謝和有機系統(tǒng))32小類共267個代謝通路。本研究通過高通量測序技術,對巖原鯉轉錄組進行測序,獲得了大量的轉錄組信息,為巖原鯉功能基因克隆及基因組學研究提供了基礎。 （共7頁）