用于Illumina測序平臺不同試劑盒制備RNA-seq文庫的方法比較

摘要： RNA-seq是利用深度測序進行轉錄組分析的技術,并且在新一代測序的主流平臺Illumina上運用廣泛。針對Illumina平臺的RNA-Seq建庫,目前有多個不同類型的建庫方法支持該技術,但是在操作步驟和成本上有很大差距。本研究分別試驗了Tru Seq RNA文庫制備、NEBNext RNA文庫制備以及KAPA RNA文庫制備3種方法,首次系統(tǒng)地對這3種建庫方法得到的片段長度,濃度和建庫流程進行了比較分析。研究顯示,3種文庫的片段長度都集中在300~1 000 bp之間,KAPA RNA文庫制備得到的文庫濃度最高,該制備方法只需要進行一次磁珠純化,操作簡便,成本低,所需要的起始量低,適用于進行大規(guī)模的建庫實驗。 （共9頁）