毛木耳rDNA序列結(jié)構(gòu)及IGS鑒別菌種初探

摘要： rDNA序列中的ITS作為DNAbarcode廣泛應(yīng)用于真菌的系統(tǒng)發(fā)育與物種輔助鑒定,IGS被認(rèn)為可以用于種內(nèi)水平不同菌株的鑒別。有關(guān)食用菌rDNA序列的報道較少。本研究對毛木耳Auricularia cornea單核菌株B02進(jìn)行三代測序與組裝,然后用二代測序數(shù)據(jù)進(jìn)行校正,得到一個組裝效果較好的基因組序列。比對Fibroporia vaillantiir的rDNA序列獲得毛木耳rDNA重復(fù)單元的完整序列,每個重復(fù)單元包含ETS、18S rDNA、ITS1、5.8S rDNA、ITS2、28S rDNA、IGS1、5S rDNA和IGS2,長度分別為398bp、1 790bp、156bp、156bp、206bp、3 432bp、2 247bp、121bp和2 135bp,總長度10 641bp,毛木耳rDNA有310個串聯(lián)重復(fù)單元,轉(zhuǎn)錄組和系統(tǒng)發(fā)育分析均支持這一結(jié)果。與其他已報道的食用菌不同,毛木耳的IGS1、IGS2序列高度保守,其中IGS1的1 400–2 200bp區(qū)域在各拷貝之間沒有多態(tài)性、而在品種之間有較高頻率的SNP,這一片段序列有望用于品種鑒別研究。 （共7頁）